[Evolución de marcadores de laboratorio en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2.] / Laboratory markers evolution in patients with persistent detection of SARS-CoV-2.

OBJECTIVE: The study of the evolution of certain biomarkers in patients with persistent detection of SARS-CoV-2 could determine the profile of the pathology that these patients may suffer. The objective of this study was to describe the evolution of different laboratory markers in patients with persistent detection of SARS-CoV-2, and determining these parameters were into reference values. METHODS: Patients were divided into two groups: the control group (G0) included patients with a positive direct test for SARS-CoV-2 followed by 2 negative, while the problem group (G1) included patients with at least 3 consecutive positive tests. The time between consecutive samples was five to twenty days, and only patients with negative serology were included. Demographic data, comorbidities, symptoms, radiology and hospitalization were collected, as well as data from analytic and blood gases. The comparison between the study groups was realized using the t-student and U Mann-Whitney test for quantitative variables, and the χ2 test for qualitative variables. Results with p<0.05 were taken as significant. RESULTS: Ninety patients were included, thirty-eight in G0 and fifty-two in G1. D-dimer decreased 10.20 times more in G0 patients, and normal levels of this parameter at t1 were 1.46 times more frequent in these patients. The percentage of lymphocytes increased sixteen times more in G0, and the normal values in t1 were 10.40 times more common in these patients. C-reactive protein decreased significantly in both groups, and lactate increased more in G1 patients. CONCLUSIONS: The results of the study suggest that some biomarkers evolve differently in patients with persistent detection of SARS-CoV-2, which may have significant clinical impact. This information could help to determine the main organs or systems affected, allowing to anticipate socio-sanitary measures to prevent or compensate these alterations.

OBJETIVO: El estudio de la evolución de algunos biomarcadores en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2 permitiría determinar el perfil de las patologías que podrían padecer. El objetivo de este estudio fue describir la evolución de distintos marcadores de laboratorio en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2 y estudiar los cambios en la proporción de pacientes con valores considerados como normales. METODOS: Los pacientes se dividieron en dos grupos: el grupo control (G0) incluyó pacientes con una prueba de detección de infección activa positiva para SARS-CoV-2 seguida de dos negativas, mientras que el grupo problema (G1) incluyó pacientes con al menos tres pruebas positivas consecutivas. El tiempo entre muestras consecutivas fue de cinco a veinte días, y se incluyeron solamente pacientes con serología negativa. Se recogieron datos demográficos, comorbilidades, sintomatología, radiología y hospitalización, así como los datos de las analíticas y las gasometrías. La comparación entre los grupos de estudio se realizó mediante el test t-student y U Mann-Whitney para variables cuantitativas, y el test de χ2 para variables cualitativas. Se tomaron como significativos resultados con p<0,05. RESULTADOS: Se incluyeron noventa pacientes, treinta y ocho en G0 y cincuenta y dos en G1. El dímero D descendió 10,20 veces más en pacientes G0, y los niveles normales de este parámetro en t1 fueron 1,46 veces más frecuentes en estos pacientes. El porcentaje de linfocitos se elevó dieciséis veces más en G0, y los valores normales en t1 fueron 10,40 veces más habituales en estos pacientes. La proteína C reactiva descendió de manera importante en ambos grupos, y el lactato aumentó más en pacientes G1. CONCLUSIONES: Los resultados del estudio sugieren que algunos biomarcadores evolucionan de manera diferente en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2, lo que podría tener importantes repercusiones clínicas. Esta información podría ayudar a determinar los principales órganos o sistemas afectados, permitiendo anticipar medidas sociosanitarias para prevenir o compensar estas alteraciones.

Evolución de marcadores de laboratorio en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2 / Laboratory markers evolution in patients with persistent detection of SARS-CoV-2

Fundamentos: El estudio de la evolución de algunos biomarcadores en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2permitiría determinar el perfil de las patologías que podrían padecer. El objetivo de este estudio fue describir la evolución de distintosmarcadores de laboratorio en pacientes con detección persistente de SARS-CoV-2 y estudiar los cambios en la proporción de pacien-tes con valores considerados como normales.Métodos: Los pacientes se dividieron en dos grupos: el grupo control (G0) incluyó pacientes con una prueba de detección de infec-ción activa positiva para SARS-CoV-2 seguida de dos negativas, mientras que el grupo problema (G1) incluyó pacientes con al menos trespruebas positivas consecutivas. El tiempo entre muestras consecutivas fue de cinco a veinte días, y se incluyeron solamente pacientescon serología negativa. Se recogieron datos demográficos, comorbilidades, sintomatología, radiología y hospitalización, así como los da-tos de las analíticas y las gasometrías. La comparación entre los grupos de estudio se realizó mediante el test t-student y U Mann-Whitneypara variables cuantitativas, y el test de χ2 para variables cualitativas. Se tomaron como significativos resultados con p<0,05. Resultados: Se incluyeron noventa pacientes, treinta y ocho en G0 y cincuenta y dos en G1. El dímero D descendió 10,20 vecesmás en pacientes G0, y los niveles normales de este parámetro en t1 fueron 1,46 veces más frecuentes en estos pacientes. El porcenta-je de linfocitos se elevó dieciséis veces más en G0, y los valores normales en t1 fueron 10,40 veces más habituales en estos pacientes.La proteína C reactiva descendió de manera importante en ambos grupos, y el lactato aumentó más en pacientes G1.Conclusiones: Los resultados del estudio sugieren que algunos biomarcadores evolucionan de manera diferente en pacientes...(AU)

B:ackground: The study of the evolution of certain biomarkers in patients with persistent detection of SARS-CoV-2 could determinethe profile of the pathology that these patients may suffer. The objective of this study was to describe the evolution of different laboratorymarkers in patients with persistent detection of SARS-CoV-2, and determining these parameters were into reference values.Methods: Patients were divided into two groups: the control group (G0) included patients with a positive direct test for SARS-CoV-2followed by 2 negative, while the problem group (G1) included patients with at least 3 consecutive positive tests. The time betweenconsecutive samples was five to twenty days, and only patients with negative serology were included. Demographic data, comorbidities,symptoms, radiology and hospitalization were collected, as well as data from analytic and blood gases. The comparison between thestudy groups was realized using the t-student and U Mann-Whitney test for quantitative variables, and the χ2 test for qualitative variables.Results with p<0.05 were taken as significant.Results: Ninety patients were included, thirty-eight in G0 and fifty-two in G1. D-dimer decreased 10.20 times more in G0 patients,and normal levels of this parameter at t1 were 1.46 times more frequent in these patients. The percentage of lymphocytes increasedsixteen times more in G0, and the normal values in t1 were 10.40 times more common in these patients. C-reactive protein decreasedsignificantly in both groups, and lactate increased more in G1 patients.Conclusions: The results of the study suggest that some biomarkers evolve differently in patients with persistent detectionof SARS-CoV-2, which may have significant clinical impact. This information could help to determine the main organs or systemsaffected, allowing to anticipate socio-sanitary measures to prevent or compensate these alterations.(AU)

[Potential usefulness of CT as a marker of persistence of positive PCR in patients with COVID-19.] / Potencial utilidad del CT como marcador de persistencia de PCR positiva en pacientes con COVID-19.

OBJECTIVE: One of the problems associated to SARS-CoV-2 was its persistence in nasopharyngeal tract. The existence of markers that help to predict this situation could be useful to management of the patients. The objective of this paper was to determine the relationship between the CT value from the initial PCR of patients with COVID-19 and the persistence of the infection. METHODS: It was performed an observational retrospective study of patients with positive PCR to SARS-CoV-2 attended in emergency department of a general hospital. Data about compatible symptoms, radiological findings and the CT value obtained with each PCR kit were collected. The control group (G0) included patients with a positive PCR followed by two negative PCR results (P-N-N), while problem group (G1) included patients with at least three consecutive positive PCR results (P-P-P). Chronic infections were discarded selecting only patients with negative serology, and only were included those whose PCR were separated by a minimum of five and maximum of twenty days. The comparison between the study groups was carried out using the t-student test for quantitative variables and the χ2 test for qualitative variables. RESULTS: The mean CT value were 30.8 and 21.5 (p<0.001) on G0 and G1, respectively. G0 reported higher CT values than G1, regardless of symptoms, radiological pattern and the PCR kit utilized. CONCLUSIONS: The CT value from the SARS-CoV-2 initial PCR is related to the persistence of its positivity, regardless of the patient´s symptoms or radiological pattern. Thus, low CT values could be related to persistent infections.

OBJETIVO: Uno de los problemas asociados al SARS-CoV-2 es su persistencia en el tracto nasofaríngeo. La existencia de marcadores que ayuden a predecir este fenómeno podría ser útil en el manejo del paciente. El objetivo de este trabajo fue determinar la relación entre el valor CT (umbral de ciclo) de la PCR inicial de pacientes con COVID-19 y la persistencia de la infección. METODOS: Se realizó un estudio observacional retrospectivo de pacientes con PCR positiva para SARS-CoV-2 atendidos en las Urgencias de un hospital general. Se recogieron datos sobre sintomatología compatible y patrón radiológico de cada paciente, así como el CT obtenido en la PCR con cada equipo utilizado. El grupo control (G0) incluyó pacientes con una PCR positiva seguida de dos negativas (patrón P-N-N), mientras que el grupo problema (G1) incluyó pacientes con al menos tres PCR positivas consecutivas (patrón P-P-P). Se descartaron las infecciones crónicas, considerando únicamente a pacientes con serología negativa, y solo se incluyeron aquellos cuyas tres PCR estuvieron separadas un mínimo de cinco días y un máximo de veinte. La comparación entre los grupos de estudio se realizó mediante el test t-student para variables cuantitativas y el test de χ2 para variables cualitativas. RESULTADOS: La media del valor CT fue de 30,8 en G0 y 21,5 en G1 (p<0,001). G0 reportó CT superiores a G1, independientemente de la sintomatología, el patrón radiológico o el equipo de PCR utilizado. CONCLUSIONES: El valor CT de la PCR inicial de SARS-CoV-2 podría relacionase con la persistencia de su positividad, independientemente de la sintomatología o el patrón radiológico del paciente. Valores bajos de CT en la primera PCR podrían relacionarse con infecciones persistentes.

Potencial utilidad del CT como marcador de persistencia de PCR positiva en pacientes con COVID-19 / Potential usefulness of CT as a marker of persistence of positive PCR in patients with COVID-19

FUNDAMENTOS: Uno de los problemas asociados al SARS-CoV-2 es su persistencia en el tracto nasofaríngeo. La existencia de marcadores que ayuden a predecir este fenómeno podría ser útil en el manejo del paciente. El objetivo de este trabajo fue determinar la relación entre el valor CT (umbral de ciclo) de la PCR inicial de pacientes con COVID-19 y la persistencia de la infección. MÉTODOS: Se realizó un estudio observacional retrospectivo de pacientes con PCR positiva para SARS-CoV-2 atendidos en las Urgencias de un hospital general. Se recogieron datos sobre sintomatología compatible y patrón radiológico de cada paciente, así como el CT obtenido en la PCR con cada equipo utilizado. El grupo control (G0) incluyó pacientes con una PCR positiva seguida de dos negativas (patrón P-N-N), mientras que el grupo problema (G1) incluyó pacientes con al menos tres PCR positivas consecutivas (patrón P-P-P). Se descartaron las infecciones crónicas, considerando únicamente a pacientes con serología negativa, y solo se incluyeron aquellos cuyas tres PCR estuvieron separadas un mínimo de cinco días y un máximo de veinte. La comparación entre los grupos de estudio se realizó mediante el test t-student para variables cuantitativas y el test de χ2 para variables cualitativas. RESULTADOS: La media del valor CT fue de 30,8 en G0 y 21,5 en G1 (p<0,001). G0 reportó CT superiores a G1, independientemente de la sintomatología, el patrón radiológico o el equipo de PCR utilizado. CONCLUSIONES: El valor CT de la PCR inicial de SARS-CoV-2 podría relacionase con la persistencia de su positividad, independientemente de la sintomatología o el patrón radiológico del paciente. Valores bajos de CT en la primera PCR podrían relacionarse con infecciones persistentes.(AU)

BACKGROUND: One of the problems associated to SARS-CoV-2 was its persistence in nasopharyngeal tract. The existence of markers that help to predict this situation could be useful to management of the patients. The objective of this paper was to determine the relationship between the CT value from the initial PCR of patients with COVID-19 and the persistence of the infection. METHODS: It was performed an observational retrospective study of patients with positive PCR to SARS-CoV-2 attended in emergency department of a general hospital. Data about compatible symptoms, radiological findings and the CT value obtained with each PCR kit were collected. The control group (G0) included patients with a positive PCR followed by two negative PCR results (P-N-N), while problem group (G1) included patients with at least three consecutive positive PCR results (P-P-P). Chronic infections were discarded selecting only patients with negative serology, and only were included those whose PCR were separated by a minimum of five and maximum of twenty days. The comparison between the study groups was carried out using the t-student test for quantitative variables and the χ2 test for qualitative variables. RESULTS: The mean CT value were 30.8 and 21.5 (p<0.001) on G0 and G1, respectively. G0 reported higher CT values than G1, regardless of symptoms, radiological pattern and the PCR kit utilized.(AU)

Quantification of plasmid copy number as surrogate marker of virulence among different invasive and non-invasive genotypes of Chlamydia trachomatis.

The population dissemination of invasive genotypes of C. trachomatis and an increase of urogenital infections cases by non-invasive genotypes have been observed in many countries. In this epidemiological context, the descriptions of a high proportion of infections related to L-genotypes in asymptomatic patients, but also to infections caused by non-L genotypes in symptomatic patients have been unexpected finding. The plasmid copy number (PCN) has been proposed as a surrogate marker of virulence. We quantified the PCN in 233 samples and 179 samples carrying L-genotype and non-L genotypes respectively. A significant difference in the median of PCN was detected between symptomatic/asymptomatic patients (P < 0.001), independently of the genotype. Moreover, PCN could vary, in the same strain, among different anatomical sites suggesting that micro-environmental changes could affect virulence. These findings suggest that the quantification of PCN in clinical samples could improve the management of patients.

Real Life Clinical Impact of Antimicrobial Stewardship Actions on the Blood Culture Workflow from a Microbiology Laboratory.

BACKGROUND: Accelerating the diagnosis of bacteremia is one of the biggest challenges in clinical microbiology departments. The fast establishment of a correct treatment is determinant on bacteremic patients' outcomes. Our objective was to evaluate the impact of antimicrobial therapy and clinical outcomes of a rapid blood culture workflow protocol in positive blood cultures with Gram-negative bacilli (GNB). METHODS: A quasi-experimental before-after study was performed with two groups: (i) control group (conventional work-protocol) and (ii) intervention group (rapid workflow-protocol: rapid identification by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time-Of-Flight (MALDI-TOF) and antimicrobial susceptibility testing (AST) from bacterial pellet without overnight incubation). Patients were divided into different categories according to the type of intervention over treatment. Outcomes were compared between both groups. RESULTS: A total of 313 patients with GNB-bacteremia were included: 125 patients in the control group and 188 in the intervention. The time from positive blood culture to intervention on antibiotic treatment decreased from 2.0 days in the control group to 1.0 in the intervention group (p < 0.001). On the maintenance of correct empirical treatment, the control group reported 2.0 median days until the clinical decision, while in the intervention group was 1.0 (p < 0.001). In the case of treatment de-escalation, a significant difference between both groups (4.0 vs. 2.0, p < 0.001) was found. A decreasing trend on the change from inappropriate treatments to appropriate ones was observed: 3.5 vs. 1.5; p = 0.12. No significant differences were found between both groups on 7-days mortality or on readmissions in the first 30-days. CONCLUSIONS: Routine implementation of a rapid workflow protocol anticipates the report of antimicrobial susceptibility testing results in patients with GNB-bacteremia, decreasing the time to effective and optimal antibiotic therapy.

Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Spreads to Lymph Nodes and Strongly Expands CD4+ Effector Memory RA Cells in a Patient With Mild Coronavirus Disease 2019.

A woman with mild coronavirus disease 2019 developed cervical adenopathy, being diagnosed of Epstein-Barr virus infectious mononucleosis. We performed fine needle aspiration, and demonstrate that severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is found in lymph nodes even in mild disease along with a strong expansion of terminally differentiated effector memory CD4+ T cells, a cell population that is practically absent in lymph nodes.